臺南市自5月15日進入「準三級」防疫階段，南區區公所於5月16日立即召開COVID-19防疫洽公應變會議，本所自5月17日起於1樓臨時洽公區設立各課室單一窗口，提供民眾業務申辦或諮詢，暫時不進入公所辦公廳內部。進入臨時洽公區域採取實聯制登記、量測體溫、手部消毒、人流管制及全配戴口罩，民眾等待之座位採間隔座位設置，確保洽公民眾保持社交距離。
因本土疫情逐漸升溫趨勢，南區區公所蕭琇華區長率隊至本區市場、夜市及人潮聚集處宣導，以沿路廣播及舉牌方式提醒現場民眾防疫期間應「配戴口罩、勤洗手及保持社交距離」，並向店家宣導排隊人潮多時要拉開社交距離、外帶為主及禁止邊走邊吃。
公園是許多民眾休閒聚會的場所，目前第三級警戒規定停止室內5人、室外10人以上的家庭聚會及社交聚會，若未依社交規定及全程佩戴口罩，容易造成群聚感染成為防疫破口，本所也會不定期派員前往宣導及稽查，維護社區安全。
本區各里、社區活動中心至5月28日（星期五)前，各項活動全面暫停，不開放民眾進入使用，開放時間俟疫情狀況調整，本所綜合所得稅代收件服務亦同時暫停受理。
全國於昨日(5/19)升至三級防疫警戒狀態，全面配合中央防堵疫情延燒，遵照各項防疫措施研議相關配套措施，協調各單位做好防疫整備。並請民眾切勿散布或傳播不實的疫情謠言或訊息，違者將依「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」第 14 條規定，散播有關嚴重特殊傳染性肺炎流行疫情之謠言或不實訊息，足生損害於公眾或他人者，處三年以下有期徒刑、拘役或科或併科新臺幣三百萬元以下罰金。
區長蕭琇華表示5月15日到5月28日，各類娛樂場所停止營業，民眾外出時全程戴口罩、避免不必要移動、活動或集會，大家共同遵守防疫規定，配合相關管制作為，以保護自身及他人的健康，齊心抗疫。