約建於西元1739年，奉祀主神是代天巡狩葉、朱、李三府千歲，為地方的信仰中心。
廟宇建築仿皇宮型態，非常壯麗規模廣大，
廟宇內部的彩繪雕刻也都是名師創作，潘麗水、蔡草如、施弘毅的作品都在其中。
每12年舉辦一次的萬皇宮王船建醮是當地的大事，在前廣場搭起跟廟宇一樣壯觀的超大型醮台及王船，
是許多文化攝影人不會錯過的攝影題材。
近年曾因喜樹聚落的「喜事集」市集大紅，也帶動的參拜人潮。而「喜樹萬皇宮龜醮」經台南市政府於110年2月公告為市定民俗。
地址：臺南市南區喜樹路222巷52號
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