因應COVID-19疫情需求，於109年2月23日正式啟用，歷經1,193天，共計42萬6,962通進線量；防疫專線人員不分晝夜及假日，24小時守護著市民，提供疫情問題之單一諮詢窗口，服務品質深受市民肯定。
回顧三年抗疫時光，防疫專線人員24小時堅守崗位，排解市民各類疑難問題，包含：隔離檢疫、就醫採檢、居隔單、快篩領取、疫苗接種等防疫諮詢。疫情初期，防疫專線需協助居家檢疫民眾奔喪與探親之安排，某位長期旅居國外之民眾，因母親病重而匆匆返台探親，返台後透過防疫專線安排採檢、防疫計程車接送及聯繫醫院探視等事宜，最後，終於順利見到母親最後一面，後續民眾也致電感謝專線人員的安排與協助，防疫專線不只是接聽電話，而是協助市民朋友解決防疫問題的好夥伴。某天深夜，確診者家屬進線：「女兒現在呼吸很喘、昏睡叫不醒…」電話那端是媽媽急促哽咽聲。於是專線人員一邊安撫媽媽情緒、一邊詢問孩子病史及相關資料後，以最快速度派遣救護車就近送至醫院，回程媽媽主動進線表示孩子狀況好轉，謝謝專線的陪伴與協助。
本市防疫專線設置亦隨著疫情與政策變化做滾動式修正，去(111)年4月一天進線數曾高達4,000多通，本市即刻增設防疫專線接線數，將2880180專線擴增至30線，另增設2880115、3901551生活關懷專線因應，以利民眾進線諮詢，防疫專線陪伴市民走過1,193天，降低市民疫情期間的恐懼和不安，是一股穩定人心的重要力量。
衛生福利部疾病管制署莊人祥署長今(5/18)日特別蒞臨記者會現場，慰勉本府各單位於防疫期間的動員與合作，黃偉哲市長也特別感謝防疫專線人員、專責醫院於疫情期間無私的貢獻與付出，攜手維護台南平安，為配合自5月1日起「嚴重特殊傳染性肺炎（COVID-19）」自第5類法定傳染病改為第4類，中央流行疫情指揮中心同步解編。臺南市防疫專線將於(5/31)功成身退，感謝所有投入防疫的夥伴，疫路走來相互扶持，共同守護市民健康。